Podstawy biologii molekularnej 2600-PBMBIOL-2-S1

Podczas wykładów omówione będą zagadnienia dotyczące: budowy i funkcji cząsteczek DNA i RNA i białek z uwzględnieniem wpływu struktury na funkcję i etapów cyklu komórkowego i jego regulacji. Realizowane będą zagadnienia odnośnie organizacji genów u organizmów eukariotycznych oraz anatomii genomów jądrowych i organellowych, organizacji genomu człowieka; roli białek wiążących DNA, inicjacja transkrypcji, poprzez syntezę i dojrzewanie RNA, syntezę i obróbkę proteomu z uwzględnieniem regulacji aktywności genomu.

Podczas zajęć laboratoryjnych realizowane będą nastepujące zagadnienia:
1. Zastosowanie metody izolacji kwasów nukleinowych (z wykorzystaniem CTAB do izolacji DNA genomowego oraz metody z wykorzystaniem odczynnika TRI Reagent do ekstrakcji RNA z tkanek roślinnych.
2. Analiza elektrofotometryczna i spektrofotometryczna jakości i ilości DNA. Restrykcja DNA z zastosowanem enzymów restrykcyjnych "rzadko i często tnących".
3. Technika PCR (identyfikacja sekwencji genu; wykonanie reakcji odwrotnej transkrypcji.
4. Analiza uzyskanych wyników odnośnie identyfikacji i analizy ekspresji genu.

W cyklu 2025/26L:

Podczas zajęć laboratoryjnych realizowane będą nastepujące zagadnienia:
1. Zastosowanie metody izolacji kwasów nukleinowych (z wykorzystaniem CTAB do izolacji DNA genomowego oraz metody z wykorzystaniem odczynnika TRI Reagent do ekstrakcji RNA z tkanek roślinnych.
2. Analiza elektrofotometryczna i spektrofotometryczna jakości i ilości DNA. Restrykcja DNA z zastosowaniem enzymów restrykcyjnych "rzadko i często tnących".
3. Technika PCR (identyfikacja sekwencji genu; wykonanie reakcji odwrotnej transkrypcji.
4. Analiza uzyskanych wyników odnośnie identyfikacji i analizy ekspresji genu.

Całkowity nakład pracy studenta

Godziny realizowane z udziałem nauczycieli (40 godz.): - udział w wykładach – 15 h - udział w ćwiczeniach - 15 h - konsultacje - 10 h Czas poświęcony na pracę indywidualna studenta (60 godz.) : - praca własna studenta - 60 h, w tym: - przygotowanie do kolokwium 20h - czytanie literatury 10h - przygotowanie do egzaminu 30h Łącznie: 100 godzin (4 ECTS)

Efekty uczenia się - wiedza

W1: zna budowę genomu jądrowego i jego rolę w funkcjonowaniu organizmów (K_W01) W2: ma wiedzę obejmującą znaczenie materiału biologicznego (materiału genetycznego, komórek i tkanek) w badaniach obejmujących diagnostykę molekularną (K_W06) W3: posiada wiedzę dotyczącą zjawisk biologicznych, chemicznych i fizycznych leżących u podstaw metod wykorzystywanych w analizie materiału genetycznego (rozumie pojęcia replikacji, transkrypcji, translacji) (K_W02) W4: zna podstawowe metody, techniki, narzędzia i materiały stosowane w biologii molekularnej (K_W23)

Efekty uczenia się - umiejętności

U1: interpretuje wyniki prowadzonych eksperymentów obejmujących metod izolacji i analizy RNA i DNA (K_U21, K_U13) U2: potrafi dobrać i zastosować techniki molekularne i technologie wykorzystywane w badaniach materiału genetycznego – izolacja DNA, RNA i białek, mapowanie restrykcyjne (K_U03) U3: potrafi właściwie dobrać i zastosować techniki molekularne do analiz różnego typu materiału biologicznego (K_U07) U4: potrafi obsługiwać sprzęt dostępny w laboratorium molekularnym U5: potrafi dbać o samokształcenie (K_U17, K_U18)

Efekty uczenia się - kompetencje społeczne

K1: potrafi korzystać z technologii informacyjnych do wyszukiwania i selekcjonowania informacji (K_K07)

Metody dydaktyczne podające

- wykład problemowy
- wykład informacyjny (konwencjonalny)

Metody dydaktyczne poszukujące

- laboratoryjna
- ćwiczeniowa
- obserwacji
- doświadczeń

Rodzaj przedmiotu

przedmiot obligatoryjny

Wymagania wstępne

Student powinien posiadać wiedzę z zakresu biochemii, biologii komórki i genetyki ogólnej.

Koordynatorzy przedmiotu

W cyklu 2023/24L:

W cyklu 2024/25L:

W cyklu 2022/23L:

W cyklu 2025/26L:

Kryteria oceniania

Warunkiem dopuszczenia studenta do pisemnego egzaminu jest zaliczenie części laboratoryjnej. Ocena zajęć praktycznych obejmuje napisanie kolokwium (kryteria podane poniżej) i poprawne wykonanie eksperymentów orz napisanie sprawozdania z wykonanych eksperymentów.
Kryterium otrzymania oceny pozytywnej z egzaminu pisemnego jest uzyskanie minimalnej liczby punktów (punktacja zamieszczona poniżej). W przypadku nie uzyskania minimalnej liczby z egzaminu pisemnego dopuszcza się dodatkowy termin. Poprawa jest identyczną metodą weryfikacji efektów kształcenia, jak w pierwszym terminie.
% uzyskanych punktów ocena
92-100 bdb
84-91. db+
76-83. db
68-75. dst+
56-67. dst
0-55 ndst
Powyższe kryteria oceny obowiązują na zaliczeniach końcowych, również poprawkowych.

Praktyki zawodowe

nie dotyczy

Literatura

1. Brown T.A.: Genomy, wyd. drugie, PWN, Warszawa 2009
3. Alberts B. i in.: Molecular biology of the cell. 5th ed., Garland Publishing 2008.
4. Sambrook J. i in.: Molecular cloning: a laboratory manual. Cold Spring Harbor Laboratory 3rd ed., 2001.
5. Lodish H. et al., Molecular cell biology 6th edition. W. H. Freeman & Co, 2007.
6. Bal J., Biologia molekularna w medycynie. PWN, Warszawa 2008.
7. Słomski R. Analiza DNA. Teoria i praktyka. Wydawnictwo Uniwersytetu Przyrodniczego
8. Turner PC: McLennan AG, Bates AD, White MRH Biologia molekularna. Krótkie wykłady. wyd, drugie, PWN, 2009
9. Rewers M., Jędrzejczyk I., Dąbrowska G. 2017. Wybrane techniki biologii molekularnej. Wydawnictwo Uczelniane Uniwersytetu Technologiczno-Przyrodniczego w Bydgoszczy, Bydgoszcz.

W cyklu 2025/26L:

Więcej informacji

Dodatkowe informacje (np. o kalendarzu rejestracji, prowadzących zajęcia, lokalizacji i terminach zajęć) mogą być dostępne w serwisie USOSweb:

Strona przedmiotu 2600-PBMBIOL-2-S1 w USOSweb