Współczesne metody badań mikroskopowych i obrazowania materiału biologicznego z elementami patologii 2600-MDW-3A-WBM
Patologia jest dyscypliną łączącą medycynę i nauki podstawowe, w szczególności biologię. Początkowo, jako nauka opisowa, skupiała się na opisie chorób i ich przebiegu, ale w miarę rozwoju nauk coraz bardziej ewoluowała od opisu molekularnego, do fizjologii organizmów, a następnie biologii komórki, genetyki i biologii molekularnej. Chociaż era biologii molekularnej rozpoczęła się ok. pięćdziesiąt lat temu, to właśnie w ostatnich dekadach patologia uprawiana na poziomie molekularnej biologii komórki weszła w erę dynamicznego rozwoju. Przedmiotem nauczania są zmiany w budowie i funkcjonowaniu komórek zachodzące w różnych stanach chorobowych człowieka, analizowane na poziomie molekularnym i cytomorfologicznym. Niektóre stany chorobowe, zwłaszcza układu krążenia i choroby nowotworowe, stanowią częstą przyczynę zgonu. Na zajęciach laboratoryjnych obserwowane są cechy obrazów mikroskopowych preparatów cytologicznych i histopatologicznych barwionych metodami standardowymi i specjalistycznymi z różnych procesów patologicznych. Analizowane są również wyniki reakcji immunohistochemicznych i hybrydyzacji in situ wykrywania określonych molekuł, których poziom zmienia się w komórkach różnych narządów w związku z procesami chorobowymi, z zastosowaniem klasycznej mikroskopii świetlnej lub fluorescencyjnej. Uczestnicy będą mogli przeprowadzić lokalizację poli(A) RNA i U2 snRNA. Studenci, posługując się zmotoryzowanym systemem mikroskopowym, zapoznają się m.in. z technikami: uzyskiwania obrazów całego preparatu o wysokiej rozdzielczości, tworzenia trójwymiarowych modeli komórek, dekonwolucją, generowaniem z użyciem oprogramowania komputerowego trójwymiarowych modeli preparatów i przekrojów optycznych w dowolnie wybranych częściach preparatów, tworzeniem obrazów preparatów o pogłębionej ostrości, obrazowaniem z zastosowaniem fluorescencji. Ponadto studenci nabywają umiejętność wykonywania laserowej mikodyssekcji subpopulacji komórek i pojedynczych komórek z preparatów mikroskopowych do dalszych badań na poziomie molekularnym. Używają sprzętu i oprogramowania komputerowego w zakresie koniecznym do rejestracji i analizy obrazów mikroskopowych oraz laserowej mikrodyssekcji. Studenci przygotują materiał do mikroskopu elektronowego a także następnie przeprowadzić analizę preparatów.
Całkowity nakład pracy studenta
Efekty uczenia się - wiedza
Efekty uczenia się - umiejętności
Efekty uczenia się - kompetencje społeczne
Metody dydaktyczne
Metody dydaktyczne eksponujące
Metody dydaktyczne podające
Metody dydaktyczne poszukujące
- doświadczeń
- ćwiczeniowa
- laboratoryjna
Rodzaj przedmiotu
Wymagania wstępne
Koordynatorzy przedmiotu
Kryteria oceniania
Zaliczenie na ocenę poszczególnych bloków tematycznych zajęć laboratoryjnych (oceniane są zrealizowane zadania) i końcowego kolokwium.W zakresie wiedzy i umiejętności (W1, W2, W3, W4, U1, U3): zaliczenie poszczególnych bloków tematycznych zajęć i końcowego kolokwium: na ocenę dostateczną student musi poprawnie zrealizować 60-70% zadań, na ocenę dostateczny plus - 71-80%, na ocenę dobry - 81-87%, na ocenę dobry plus - 88-94%, na ocenę bardzo dobry - powyżej 94%. W zakresie kompetencji społecznych: oceniana jest aktywność studenta na zajęciach i jego zaangażowanie oraz praca zespołowa. Ocena w skali 2-5. Ocena ostateczna z zajęć laboratoryjnych: średnia z uśrednionych ocen uzyskanych na zajęciach i oceny z końcowego kolokwium.
Literatura
Literatura obowiązkowa:
1. Biggs D.S.C. - “A Practical Guide to Deconvolution of Fluorescence Microscope Imagery”, Microscopy Today, Vol. 18 (10-14) 2010
2. Kumar V., Cotran R.S., Robbins S.L., wydanie polskie Olszewski W.T. (red.) - „Patologia”, Wydawnictwo Medyczne Urban & Partner, Wrocław, 2005
3. Stevens A., Lowe J., wydanie polskie Korobowicz E. (red.) - „Patologia”, Wydawnictwo Czelej, Lublin, 2004
4. Wegerhoff R., Weidlich O., Kässens M. - “Basics of Light Microscopy Imaging“, Git Verlag A Wiley Company, Darmstadt, Olympus, Hamburg, 2007 - materiały dostępne na stronie internetowej www.analyticalscience.wiley.com/content/magazine-do/basics-light-microscopy-imaging
5. Wizińska P., Dzięgiel P. - „Mikrodysekcja laserowa – nowoczesna technika wykorzystywana w biologii molekularnej”, Postępy Biologii Komórki, Tom 38 (453-465) 2011
Literatura uzupełniająca:
1. Domagała W.M. Chosia, E. Bedner - „Tajemniczy świat chorych komórek”, Wydawnictwo Pomorskiej Akademii Medycznej, Szczecin, 2000
2. “User Manual: mmi CellCut Plus”, Molecular Machines & Industries, Glattbrugg, Switzerland 2007 - materiały dostępne na zajęciach
3. Aktualne publikacje z czasopism i sympozjów międzynarodowych
|
W cyklu 2024/25Z:
1. Biggs D.S.C. - “A Practical Guide to Deconvolution of Fluorescence Microscope Imagery”, Microscopy Today, Vol. 18 (10-14) 2010 |
Więcej informacji
Dodatkowe informacje (np. o kalendarzu rejestracji, prowadzących zajęcia, lokalizacji i terminach zajęć) mogą być dostępne w serwisie USOSweb: