Techniki wizualizacji struktury i funkcji komórki
2600-K5-TWK-BIOT
W trakcie trwania zajęć studenci teoretycznie poznają nowoczesne urządzenia oraz techniki służące do bioobrazowania komórkowego oraz uzyskują praktyczne umiejętności takie jak:
• przygotowanie materiału do obserwacji w mikroskopie elektronowym w zależności od ich późniejszego wykorzystania
• wpływ różnych mieszanin utrwalających na jakość uzyskanej ultrastruktury
• zastosowanie techniki kontrastowania do identyfikacji białek, RNA i DNA na poziomie mikroskopu elektronowego
• obsługa ultramikrotomu, mikroskopu elektronowego, mikroskopu konfokalnego
• rejestracja obrazów cyfrowych o wysokiej jakości i rozdzielczości z użyciem mikroskopu świetlnego i fluorescencyjnego
• obsługa oprogramowania do analizy morfometrycznej oraz pomiarów morfometrycznych i densytometrycznych
• uzyskiwanie trójwymiarowych obrazów metodą cięcia optycznego z użyciem mikroskopu fluorescencyjnego i programu do dekonwolucji obrazu
• uzyskania trójwymiarowych obrazów metodą cięcia optycznego z użyciem mikroskopu konfokalnego
|
W cyklu 2022/23:
W trakcie trwania zajęć studenci teoretycznie poznają nowoczesne urządzenia oraz techniki służące do bioobrazowania komórkowego oraz uzyskują praktyczne umiejętności takie jak:
• przygotowanie materiału do obserwacji w mikroskopie elektronowym w zależności od ich późniejszego wykorzystania
• wpływ różnych mieszanin utrwalających na jakość uzyskanej ultrastruktury
• zastosowanie techniki kontrastowania do identyfikacji białek, RNA i DNA na poziomie mikroskopu elektronowego
• obsługa ultramikrotomu, mikroskopu elektronowego, mikroskopu konfokalnego
• rejestracja obrazów cyfrowych o wysokiej jakości i rozdzielczości z użyciem mikroskopu świetlnego i fluorescencyjnego
• obsługa oprogramowania do analizy morfometrycznej oraz pomiarów morfometrycznych i densytometrycznych
• uzyskiwanie trójwymiarowych obrazów metodą cięcia optycznego z użyciem mikroskopu fluorescencyjnego i programu do dekonwolucji obrazu
• uzyskania trójwymiarowych obrazów metodą cięcia optycznego z użyciem mikroskopu konfokalnego
|
W cyklu 2023/24:
W trakcie trwania zajęć studenci teoretycznie poznają nowoczesne urządzenia oraz techniki służące do bioobrazowania komórkowego oraz uzyskują praktyczne umiejętności takie jak:
• przygotowanie materiału do obserwacji w mikroskopie elektronowym w zależności od ich późniejszego wykorzystania
• wpływ różnych mieszanin utrwalających na jakość uzyskanej ultrastruktury
• zastosowanie techniki kontrastowania do identyfikacji białek, RNA i DNA na poziomie mikroskopu elektronowego
• obsługa ultramikrotomu, mikroskopu elektronowego, mikroskopu konfokalnego
• rejestracja obrazów cyfrowych o wysokiej jakości i rozdzielczości z użyciem mikroskopu świetlnego i fluorescencyjnego
• obsługa oprogramowania do analizy morfometrycznej oraz pomiarów morfometrycznych i densytometrycznych
• uzyskiwanie trójwymiarowych obrazów metodą cięcia optycznego z użyciem mikroskopu fluorescencyjnego i programu do dekonwolucji obrazu
• uzyskania trójwymiarowych obrazów metodą cięcia optycznego z użyciem mikroskopu konfokalnego
|
W cyklu 2024/25:
W trakcie trwania zajęć studenci teoretycznie poznają nowoczesne urządzenia oraz techniki służące do bioobrazowania komórkowego oraz uzyskują praktyczne umiejętności takie jak:
• przygotowanie materiału do obserwacji w mikroskopie elektronowym w zależności od ich późniejszego wykorzystania
• wpływ różnych mieszanin utrwalających na jakość uzyskanej ultrastruktury
• zastosowanie techniki kontrastowania do identyfikacji białek, RNA i DNA na poziomie mikroskopu elektronowego
• obsługa ultramikrotomu, mikroskopu elektronowego, mikroskopu konfokalnego
• rejestracja obrazów cyfrowych o wysokiej jakości i rozdzielczości z użyciem mikroskopu świetlnego i fluorescencyjnego
• obsługa oprogramowania do analizy morfometrycznej oraz pomiarów morfometrycznych i densytometrycznych
• uzyskiwanie trójwymiarowych obrazów metodą cięcia optycznego z użyciem mikroskopu fluorescencyjnego i programu do dekonwolucji obrazu
• uzyskania trójwymiarowych obrazów metodą cięcia optycznego z użyciem mikroskopu konfokalnego
|
W cyklu 2025/26:
W trakcie trwania zajęć studenci teoretycznie poznają nowoczesne urządzenia oraz techniki służące do bioobrazowania komórkowego oraz uzyskują praktyczne umiejętności takie jak:
• przygotowanie materiału do obserwacji w mikroskopie elektronowym w zależności od ich późniejszego wykorzystania
• wpływ różnych mieszanin utrwalających na jakość uzyskanej ultrastruktury
• zastosowanie techniki kontrastowania do identyfikacji białek, RNA i DNA na poziomie mikroskopu elektronowego
• obsługa ultramikrotomu, mikroskopu elektronowego, mikroskopu konfokalnego
• rejestracja obrazów cyfrowych o wysokiej jakości i rozdzielczości z użyciem mikroskopu świetlnego i fluorescencyjnego
• obsługa oprogramowania do analizy morfometrycznej oraz pomiarów morfometrycznych i densytometrycznych
• uzyskiwanie trójwymiarowych obrazów metodą cięcia optycznego z użyciem mikroskopu fluorescencyjnego i programu do dekonwolucji obrazu
• uzyskania trójwymiarowych obrazów metodą cięcia optycznego z użyciem mikroskopu konfokalnego
|
Całkowity nakład pracy studenta
Godziny realizowane z udziałem nauczycieli (30 godz.):
- udział w ćwiczeniach audytoryjnych - 5 godz.
- udział w ćwiczeniach laboratoryjnych - 25 godz.
- udział w ćwiczeniach terenowych– 0
Czas poświęcony na pracę indywidualną studenta (32,5 godz.):
- przygotowanie do ćwiczeń - 10 godz
- praca własna nad opracowaniem projektu, pracy zaliczeniowej, sprawozdania, referatu lub prezentacji – 22,5
Łącznie 62,5 godz. (2,5 ECTS)
Efekty uczenia się - wiedza
W1: Student poznaje nowe techniki oraz urządzenia bioobrazowania komórkowego – K_W03, K_W04, K_W11, K_W15
W2: Zna podstawowe mechanizmy etapów przygotowanie materiału do badań w mikroskopie elektronowym – K_W03, K_W11
W3: Dobiera odpowiednie techniki mikroskopowe do postawionych zadań badawczych - K_W07, K_W09
W4: Zna zasady właściwej rejestracji obrazów w mikroskopie fluorescencyjnym i konfokalnym – K_W11, K_W14
Efekty uczenia się - umiejętności
U1: Potrafi przygotować materiał badawczy do obserwacji ultrastrukturalnych w mikroskopie elektronowym. Umie przeprowadzić etapy utrwalania, odwadniania, zatapiania materiału, kontrastowania materiału biologicznego- K_U01, K_U07, K_U011
U2: Analizuje obrazy z mikroskopu elektronowego potrafi je ocenić i właściwie zinterpretować – K_U06, K_U07, K_U08
U3: Obsługuje różnego typu urządzenia do rejestracji obrazu mikroskopowego, a także podstawowe funkcje oprogramowania do pomiarów morfometrycznych i pomiarów ilościowych – K_U01, K_U06, K_U07, K_U08, K_U09, K_U11
Efekty uczenia się - kompetencje społeczne
K1: Ma świadomość postępu wiedzy w technikach bioobrazowania – K_K01, K_K02, K_K07
K2: Ma świadomość odpowiedzialności za rzetelność przeprowadzonych analiz i badań– K_K02, K_K06
K3: Wykazuje szczególną dbałość o specjalistyczną aparaturę badawczą wykorzystywaną podczas realizacji zajęć laboratoryjnych – K_K06, K_K09
Metody dydaktyczne
Ćwiczenia laboratoryjne: Wstęp teoretyczny - prezentacja multimedialna, dyskusja. Cześć praktyczna - wykonywanie zadań zgodnie z instrukcją ćwiczeń w 2-4 osobowych zespołach (zależnie od tematu ćwiczeń), nadzorowanych przez osobę prowadzącą zajęcia. Ze względu na bezpieczeństwo i higienę pracy (m.in. szkodliwe odczynniki chemiczne) oraz cenną aparaturę badawczą, konieczne jest prowadzenie zajęć w grupach 8-12 osobowych. Ponadto ograniczona ilość osób w grupach warunkuje możliwość pełnego korzystania przez studentów z laboratorium oraz specjalistycznego sprzętu.
Metody dydaktyczne eksponujące
- pokaz
Metody dydaktyczne podające
- wykład informacyjny (konwencjonalny)
- wykład konwersatoryjny
Metody dydaktyczne poszukujące
- doświadczeń
- ćwiczeniowa
- laboratoryjna
- obserwacji
Rodzaj przedmiotu
przedmiot fakultatywny
Wymagania wstępne
brak
Koordynatorzy przedmiotu
Kryteria oceniania
Ćwiczenia laboratoryjne: zaliczenie końcowe obejmujące sprawozdanie z przeprowadzonych technik oraz analizę wyników. Ocena ciągła (bieżące przygotowanie studentów do ćwiczeń i ich aktywność); istotnym warunkiem zaliczenia jest co najmniej 80% frekwencja, ocena końcowa wyliczana jest jako średnia uzyskanych ocen; do 3,39 – dostateczny, 3,40-3,74 – dostateczny plus, 3,75-4,19 – dobry, 4,20-4,50 – dobry plus, powyżej 4,50 – bardzo dobry.
Sprawozdanie - K_W01, K_W02, K_W11, K_W14
Aktywność na ćwiczeniach – K _W15, K_W16, K_U01, K_U02, K_U06, K_U07, K_U08, K_U09, K_U10, K_U11, K_K03, K_K04, K_K05, K_K06, K_K08
Praktyki zawodowe
Literatura
1) Wróbel, B., Zienkiewicz, K., Smoliński, D.J., Niedojadło, J., Świdziński, M., 2005. Podstawy mikroskopii elektronowej. Skrypt dla studentow biologii. Wydawnictwo Uniwersytetu Mikolaja Kopernika, Toruń.
2) Alberts B., D. Bray, K. Hopkin, A. Johnson, J. Lewis, M. Raff, K. Roberts, P. Walter. 2009. Postawy biologii komórki. Tom 1 i 2 + CD. Wyd. II. Wydawnictwo Naukowe PWN.
3) Hayat MA., 2000. Principles and techniques of electron microscopy. Cambrige of University Press 2000
|
W cyklu 2022/23:
1) Wróbel, B., Zienkiewicz, K., Smoliński, D.J., Niedojadło, J., Świdziński, M., 2005. Podstawy mikroskopii elektronowej. Skrypt dla studentow biologii. Wydawnictwo Uniwersytetu Mikolaja Kopernika, Toruń.
2) Alberts B., D. Bray, K. Hopkin, A. Johnson, J. Lewis, M. Raff, K. Roberts, P. Walter. 2009. Postawy biologii komórki. Tom 1 i 2 + CD. Wyd. II. Wydawnictwo Naukowe PWN.
3) Hayat MA., 2000. Principles and techniques of electron microscopy. Cambrige of University Press 2000 |
W cyklu 2023/24:
1) Wróbel, B., Zienkiewicz, K., Smoliński, D.J., Niedojadło, J., Świdziński, M., 2005. Podstawy mikroskopii elektronowej. Skrypt dla studentow biologii. Wydawnictwo Uniwersytetu Mikolaja Kopernika, Toruń.
2) Alberts B., D. Bray, K. Hopkin, A. Johnson, J. Lewis, M. Raff, K. Roberts, P. Walter. 2009. Postawy biologii komórki. Tom 1 i 2 + CD. Wyd. II. Wydawnictwo Naukowe PWN.
3) Hayat MA., 2000. Principles and techniques of electron microscopy. Cambrige of University Press 2000 |
W cyklu 2024/25:
1) Wróbel, B., Zienkiewicz, K., Smoliński, D.J., Niedojadło, J., Świdziński, M., 2005. Podstawy mikroskopii elektronowej. Skrypt dla studentow biologii. Wydawnictwo Uniwersytetu Mikolaja Kopernika, Toruń.
2) Alberts B., D. Bray, K. Hopkin, A. Johnson, J. Lewis, M. Raff, K. Roberts, P. Walter. 2009. Postawy biologii komórki. Tom 1 i 2 + CD. Wyd. II. Wydawnictwo Naukowe PWN.
3) Hayat MA., 2000. Principles and techniques of electron microscopy. Cambrige of University Press 2000 |
W cyklu 2025/26:
1) Wróbel, B., Zienkiewicz, K., Smoliński, D.J., Niedojadło, J., Świdziński, M., 2005. Podstawy mikroskopii elektronowej. Skrypt dla studentow biologii. Wydawnictwo Uniwersytetu Mikolaja Kopernika, Toruń.
2) Alberts B., D. Bray, K. Hopkin, A. Johnson, J. Lewis, M. Raff, K. Roberts, P. Walter. 2009. Postawy biologii komórki. Tom 1 i 2 + CD. Wyd. II. Wydawnictwo Naukowe PWN.
3) Hayat MA., 2000. Principles and techniques of electron microscopy. Cambrige of University Press 2000 |
Więcej informacji
Dodatkowe informacje (np. o kalendarzu rejestracji, prowadzących zajęcia, lokalizacji i
terminach zajęć) mogą być dostępne w serwisie USOSweb: