Metody analiz mikroskopowych
2600-DM-MAM-1-S2
Na ćwiczeniach rozpoczynających się wstępem teoretycznym studenci poznają następujące procedury:
• immunofluorescencyjna lokalizacja antygenów z wykorzystaniem mikroskopii fluorescencyjnej i/lub konfokalnej
• detekcja RNA przy zastosowaniu techniki FISH (ang. fluorescent in situ hybridization) wykorzystaniem mikroskopii fluorescencyjnej i/lub konfokalnej
• obsługa ultramikrotomu, mikroskopu świetlnego, fluorescencyjnego, konfokalnego i elektronowego
• rejestracja obrazów cyfrowych o wysokiej rozdzielczości z użyciem mikroskopu świetlnego i fluorescencyjnego
• obsługa oprogramowania do wykonania pomiarów morfometrycznych i densytometrycznych.
Całkowity nakład pracy studenta
Godziny realizowane z udziałem nauczycieli (26 godz.):
- udział w ćwiczeniach audytoryjnych - 8
- udział w ćwiczeniach laboratoryjnych - 18
- udział w ćwiczeniach terenowych– 0
Czas poświęcony na pracę indywidualną studenta (32,5 godz.):
- przygotowanie do ćwiczeń - 5
- praca własna nad opracowaniem projektu, pracy zaliczeniowej, sprawozdania, referatu lub prezentacji – 22,5
- konsultacje i praca z nauczycielem akademickim - 5
Efekty uczenia się - wiedza
W1: Student poznaje nowe techniki oraz urządzenia bioobrazowania komórkowego – K_W03, K_W04, K_W11, K_W15
W2: Zna podstawowe mechanizmy etapów przygotowanie materiału do badań w mikroskopie elektronowym – K_W03, K_W11
W3: Dobiera odpowiednie techniki mikroskopowe do postawionych zadań badawczych - K_W07, K_W09
W4: Zna zasady właściwej rejestracji obrazów w mikroskopie fluorescencyjnym i konfokalnym – K_W11, K_W14
Efekty uczenia się - umiejętności
U1: Potrafi przygotować materiał biologiczny do obserwacji mikroskopowych z wykorzystaniem różnych technik bioobrazowania na poziomie komórkowym i subkomórkowym - K_U03, K_U10,
U2: Potrafi wykonać analizy cytochemiczne, immunocytochemiczne, ultrastrukturalne oraz hybrydyzację in situ na poziomie mikroskopu świetlnego i/lub elektronowego - K_U03, K_U10
U3: Analizuje i rejestruje obrazy mikroskopowe, potrafi ocenić ich jakość pod względem technicznym i właściwie zinterpretować otrzymywane wyniki badań – K_U13, K_U14, K_U15, K_U21
U4: Obsługuje podstawowe funkcje oprogramowania do pomiarów morfometrycznych i ilościowych – K_U13, K_U15, K_U21
Efekty uczenia się - kompetencje społeczne
K1: Ma świadomość postępu wiedzy w technikach bioobrazowania – K_K01, K_K02, K_K07
K2: Ma świadomość odpowiedzialności za rzetelność przeprowadzonych analiz i badań– K_K02, K_K06
K3: Wykazuje szczególną dbałość o specjalistyczną aparaturę badawczą wykorzystywaną podczas realizacji zajęć laboratoryjnych – K_K06, K_K09
Metody dydaktyczne
Ćwiczenia laboratoryjne: Wstęp teoretyczny - prezentacja multimedialna, dyskusja. Cześć praktyczna - wykonywanie zadań zgodnie z instrukcją ćwiczeń w 2-4 osobowych zespołach (zależnie od tematu ćwiczeń), nadzorowanych przez osobę prowadzącą zajęcia. Ze względu na bezpieczeństwo i higienę pracy (m.in. szkodliwe odczynniki chemiczne) oraz cenną aparaturę badawczą, konieczne jest prowadzenie zajęć w grupach 8-12 osobowych. Ponadto ograniczona ilość osób w grupach warunkuje możliwość pełnego korzystania przez studentów z laboratorium oraz specjalistycznego sprzętu.
Rodzaj przedmiotu
przedmiot obligatoryjny
Wymagania wstępne
Podstawowa wiedza z zakresu biologii komórki.
Koordynatorzy przedmiotu
Kryteria oceniania
Metoda oceniania:
Zaliczenie na ocenę (test końcowy) - K_W04, K_W05, K_W21, K_W22, K_W23; aktywność w trakcie zajęć - K_K01, K_K02, K_K03
Kryteria oceniania:
- co najmniej 80% frekwencja na zajęciach
- wymagany próg (zaliczenie końcowe):
60% - dostateczny
61-68% - dostateczny plus
69-76% - dobry
77-84% - dobry plus
Literatura
1. Alberts B., D. Bray, K. Hopkin, A. Johnson, J. Lewis, M. Raff, K. Roberts, P. Walter. Postawy biologii komórki. Tom 1 i 2 + CD. Wyd. II. Wydawnictwo Naukowe PWN, 2009
2. Kilarski W. Strukturalne podstawy biologii komórki. Wydawnictwo Naukowe PWN, 2003
3. Wróbel B., K. Zienkiewicz, D. J. Smoliński, J. Niedojadło,
M. Świdziński. Podstawy mikroskopii elektronowej. Wydawnictwo Uniwersytetu Mikołaja Kopernika, 2005
4. Litwin J. A., M. Gajda. Podstawy technik mikroskopowych. Wydawnictwo Uniwersytetu Jagiellońskiego, 2011
Więcej informacji
Dodatkowe informacje (np. o kalendarzu rejestracji, prowadzących zajęcia, lokalizacji i
terminach zajęć) mogą być dostępne w serwisie USOSweb: