Diagnostyka molekularna w laboratoriach przemysłowych 2600-DM-DML-2-S2

https://moodle.umk.pl/course/view.php?id=9539 (w cyklu 2025/26L)

Wykład obejmuje 10 godzin zajęć. Przewidziano 5 wykładów trwających po 90 min.

Wyk. 1 Ogólne informacje dotyczące diagnostyki mikrobiologicznej w laboratoriach przemysłowych. Zagrożenia związane z obecnością patogenów w produktach spożywczych. Charakterystyka wybranych patogenów.
Wyk. 2. Metody biochemiczne i biofizyczne w wykrywaniu patogenów
Wyk. 3 Metody immunologiczne w wykrywaniu patogenów
Wyk. 4 Metody biologii molekularnej w identyfikacji patogenów
Wyk. 5 Metody biologii molekularnej w identyfikacji patogenów c.d.

Ćwiczenia laboratoryjne obejmują 20 godzin zajęć. Będą one realizowane w trakcie 5 ćwiczeń trwających 180 min.

Ćw. 1 Rozporządzenia i normy ISO w laboratoriach przemysłowych.
Ćw. 2 Analiza mikrobiologiczna powierzchni i powierza.
Ćw. 3 Zastosowanie podłoży chromogennych w diagnostyce mikroorganizmów.
Ćw. 4 Zastosowanie techniki PCR w diagnostyce mikroorganizmów.
Ćw. 5 Identyfikacja bakterii w oparciu o informację genetyczną (WGS). Podsumowanie i zaliczenie ćwiczeń.

Całkowity nakład pracy studenta

40 godzin obejmujących: pracę z nauczycielem:20 godz konsultacje : 1 godz praca indywidualna: 15 godz przygotowanie opracowania: 4 godz

Efekty uczenia się - wiedza

W1: student ma pogłębioną wiedzę teoretyczną dotyczącą biologii molekularnej, w tym metod wykorzystywanych w celach diagnostycznych i badawczych - K_W01 W2: zna podstawowe zagadnienia związane z procesem walidacji oraz normami dotyczącymi Dobrej Praktyki Laboratoryjnej (GPL) - K_W18 W3: ma pogłębioną wiedzę z dyscyplin kierunkowych umożliwiającą pracę badawczą i działania praktyczne w zakresie diagnostyki molekularne - K_W19 W4: definiuje zadanie lub problem badawczy w zakresie swojej specjalności i dobiera właściwe metody/procedury do ich rozwiązania - K_W21

Efekty uczenia się - umiejętności

U1: student jest zdolny do pracy indywidualnej orazw grupie - K_U01 U2: wykorzystuje wiedzę dotyczącą struktury i właściwościami biomolekuł (sond molekularnych, przeciwciał, enzymów, rekombinowanych kwasów nukleinowych i białek), w tym cząsteczek chimerowych, do przeprowadzenia analiz diagnostycznych i procesu badawczego - K_U04 U3: wykorzystuje wiedzę w zakresie markerów molekularnych w trakcie procesu diagnostycznego i badawczego - K_U10 U4: potrafi wybrać i zastosować odpowiednie metody diagnostyczne i analityczne w określonym typie analizy oraz zinterpretować otrzymane wyniki -K_U12

Efekty uczenia się - kompetencje społeczne

K1: ma świadomość i potrafi uzasadnić znaczenie rozwoju nauki i technologii dla służby zdrowia, przemysłu i gospodarki - K_K06 K2: ma świadomość i rozumie pozatechniczne skutki działalności diagnosty molekularnego i związanej z tym odpowiedzialności, w szczególności wpływu na środowisko i zdrowie ludzi - K_K08 K3: krytycznie analizuje wyniki własnych badań i badań innych autorów i ma świadomość konieczności podejmowania działań podnoszących wartość badań i zwiększających efektywność pracy - K_K10

Koordynatorzy przedmiotu

Agnieszka Kalwasińska

Metody dydaktyczne

Metoda podająca – wykład informacyjny, zajęcia praktyczne - zajęcia laboratoryjne

Metody dydaktyczne podające

- wykład informacyjny (konwencjonalny)
- opis

Metody dydaktyczne poszukujące

- ćwiczeniowa
- doświadczeń
- laboratoryjna

Wymagania wstępne

Podstawowa wiedza z biologii ogólnej i molekularnej.

Kryteria oceniania

Aktywność
Kolokwium zaliczeniowe
Wykład - zaliczenie
Zajęcia laboratoryjne– zaliczenie na ocenę (55-65% dostateczny, >65-75% dostateczny plus, >75-85% dobry, >85-95% dobry plus, >95% bardzo dobry).

Literatura

Literatura obowiązkowa:
1. World Health Organization. (2015). WHO estimates of the global burden of foodborne diseases: Foodborne disease burden epidemiology reference group 2007–2015. WHO Press.
2. Rozporządzenie Komisji (WE) nr 2073/2005 z dnia 15 listopada 2005 r. w sprawie kryteriów mikrobiologicznych dotyczących środków spożywczych, Dz.U. L 338 z 22.12.2005, s. 1.
3. Rozporządzenie Ministra Zdrowia z dnia 19 marca 2020 r. w sprawie metod oznaczeń próbek niezbędnych do kontroli bezpieczeństwa produktów kosmetycznych, Dz.U. 2020 poz. 549.

Literatura uzupełniająca:

1. Jodi Woan-Fei Law, Nurul-Syakima Ab Mutalib, Kok-Gan Chan, and Learn-Han Lee. Rapid methods for the detection of foodborne bacterial pathogens: principles, applications, advantages and limitations. Front Microbiol. 2014; 5: 770.
2. Thomas Bintsis. Foodborne pathogens. AIMS Microbiol. 2017; 3(3): 529–563
3. Lipika Pansare Godambe, Jayant Bandekar, Ravindranath Shashidha. Species-specific PCR based detection of Escherichia coli from Indian foods. 3 Biotech (2017) 7:130.
Ashwani Kumar, Sunita Grover, Virender Kumar Batish.Exploring specific primers targeted against different genes for a multiplex PCR for detection of Listeria monocytogenes. 3 Biotech (2015) 5:261–269.
4. Marco Fontanot, Lucilla Iacumin, Francesca Cecchini, Giuseppe Comi, Marisa Manzano. PorA specific primers for the identification of Campylobacter species
in food and clinical samples. LWT - Food Science and Technology 58 (2014) 86e92.

Uwagi

W cyklu 2025/26L:

Wykłady i laboratoria odbywają się w poniedziałki wg. następującego harmonogramu:

Wykłady:
23 luty
2 marca
9 marca
16 marca
Laboratoria:
23 luty
2 marca
9 marca
16 marca
23 marca

Więcej informacji

Dodatkowe informacje (np. o kalendarzu rejestracji, prowadzących zajęcia, lokalizacji i terminach zajęć) mogą być dostępne w serwisie USOSweb:

Strona przedmiotu 2600-DM-DML-2-S2 w USOSweb