Biochemia dynamiczna 2600-BCHDBIOT-2-S1

Wykłady z biochemii dynamicznej obejmują następujące zagadnienia:
Metabolizm - podstawowe pojęcia i strategia ogólna. Enzymy - podstawowe pojęcia, klasyfikacja. Koenzymy oksydoreduktaz i transferaz. Kinetyka reakcji enzymatycznych. Potencjał przenoszenia grup, aktywne metabolity. Glikoliza. Fosforylacja substratowa, fermentacja mleczanowa i alkoholowa. Metabolizm glikogenu. Przemiana pirogronianu do acetylokoenzymu A w mitochondriach i utlenianie reszty acetylowej w cyklu kwasu cytrynowego (cyklu Krebsa). Cykl glioksalowy. Budowa i funkcja łańcucha transportu elektronów (łańcucha oddechowego). Sprzężenie reakcji oksydacyjno-redukcyjnych z syntezą ATP. Glukoneogeneza. Przemiany umożliwiające syntezę glukozy z glicerolu, mleczanu i niektórych aminokwasów. Szlak pentozofosforanowy - alternatywny szlak metabolizmu glukozy. Połączenie szlaku pentozofosforanowego z glikolizą za pośrednictwem reakcji transketolacji i transaldolacji. Metabolizm triacylogliceroli (utlenianie kwasów tłuszczowych; szlak biosyntezy kwasów tłuszczowych). Biosynteza ciał ketonowych i cholesterolu. Enzymatyczna degradacja białek i katabolizm aminokwasów. Reakcje transaminacji i deaminacji. Dekarboksylacja aminokwasów - synteza amin biogennych. Cykl mocznikowy. Fotosynteza (reakcje świetlne fotosyntezy, transport elektronów, generowanie gradientu protonowego i synteza ATP w procesie fosforylacji fotosyntetycznej, redukcja NADP; cykl Calvina i fotooddychanie). Integracja metabolizmu - przemiany glukozo-6-fosforanu, acetylo-CoA, pirogronianu w zależności od warunków fizjologicznych.

Całkowity nakład pracy studenta

Godziny realizowane z udziałem nauczycieli (60 godz.): - udział w wykładach – 30 h - udział w ćwiczeniach - 30 h Czas poświęcony na pracę indywidualna studenta (65 godz.) : - praca własna studenta - 65 h Razem - 125 godzin (5 ECTS)

Efekty uczenia się - wiedza

W1: zna podstawowe pojęcia związane z metabolizmem i jego organizacją K_W03 W2: zna budowę i właściwości enzymów oraz mechanizm katalizy enzymatycznej W_09 W3: wyjaśnia procesy przetwarzania i magazynowania energii K_W09 W4: definiuje i opisuje anaboliczne i kataboliczne szlaki metabolizmu podstawowego K_W09 W5: identyfikuje składniki puli metabolicznej wykorzystywane w przemianach katabolicznych do pozyskiwania energii, a w przemianach anabolicznych do biosyntezy nowych bardziej złożonych cząsteczek K_W10 W6: zna metody stosowane do wykrywania i oznaczania, aktywności enzymatycznej oraz wybranych metabolitów K_W16

Efekty uczenia się - umiejętności

U1: potrafi znaleźć literaturę z zakresu studiowanego przedmiotu K_U03, K_U15 U2: przeprowadza pod kontrolą opiekuna analizy ilościowe i jakościowe z wykorzystaniem różnych materiałów biologicznych K_U01 U3: stosuje metody enzymatyczne do analizy metabolitów w materiale biologicznym K_U01; K_U11 U4: potrafi dokumentować i analizować wyniki przeprowadzonych doświadczeń K_U03; K_U14

Efekty uczenia się - kompetencje społeczne

K1: akceptuje konieczność znajomości metod matematyczno-statystycznych i informatycznych w biochemii K_K02 K2: jest chętny do pracy zespołowej respektując zdanie innych członków zespołu K_K03; K_K04 K3: dba o sprzęt, który wykorzystuje w laboratorium K_K09 K4: rozwija umiejętność krytycznej oceny uzyskanych wyników K_K07 K5: dostrzega potrzebę pogłębiania wiedzy jako podstawy do rozwoju przyszłej kariery zawodowej K_K01

Metody dydaktyczne

1. Wykład: wykład informacyjny (konwencjonalny) z prezentacją opartą na programie Power Point 2. Ćwiczenia laboratoryjne - studenci pracują w grupach 10 osobowych. Wykonują zaplanowane ćwiczenia w parach, według wcześniej otrzymanych szczegółowych instrukcji pisemnych, po wstępnym omówieniu podstaw teoretycznych i zaplanowaniu pracy.

Metody dydaktyczne podające

- wykład informacyjny (konwencjonalny)

Metody dydaktyczne poszukujące

- laboratoryjna

Rodzaj przedmiotu

przedmiot obligatoryjny

Wymagania wstępne

Zaliczony kurs z biochemii strukturalnej. Kurs podstawowy z chemii ogólnej i organicznej; podstawy biologii komórki

Koordynatorzy przedmiotu

Maciej Ostrowski

Kryteria oceniania

Warunkiem przystąpienia do egzaminu jest zaliczenie ćwiczeń.

Ćwiczenia: każde ćwiczenie laboratoryjne rozpoczyna się krótkim sprawdzianem ustnym lub pisemnym dotyczącym znajomości instrukcji oraz wiedzy koniecznej do wykonania danego ćwiczenia. Pojedyncze ćwiczenia są zaliczane na podstawie obecności na ćwiczeniach i pozytywnej oceny raportu pisemnego z wykonanego ćwiczenia. Po każdym bloku ćwiczeniowym odbywają się zajęcia teoretyczne oraz sprawdzian pisemny podsumowujący ćwiczenia danego bloku. Każdy blok ćwiczeniowy musi być zaliczony na ocenę co najmniej dostateczną. Zaliczenie końcowe z ćwiczeń uzyskuje się na podstawie obecności, zaliczonych raportów oraz średniej oceny ze wszystkich sprawdzianów kończących poszczególne bloki ćwiczeniowe. Przewidziany jest sprawdzian zaliczeniowy poprawkowy dla osób, które nie uzyskały średniej oceny końcowej dostatecznej.

Egzamin: forma pisemna, pytania problemowe sprawdzające znajomość szlaków metabolicznych (wzorów reagentów, nazw enzymów i kofaktorów) oraz ich regulacji.

Kryteria oceny: wymagany próg na ocenę dostateczną: 50-60%, 61-70% dostateczny plus, 71-80% - dobry, 81-90% - dobry plus, 91-100% - bardzo dobry

Praktyki zawodowe

nie dotyczy

Literatura

Literatura do wykładów/egzaminu:
Stryer L, Tymoczko JL, Berg JM. Biochemia. PWN, 2007, 2009, 2011, 2018
Murray RK, Granner DK, Rodwel lVW. Biochemia Harpera. PZWL, 2008
Kłyszejko-Stefanowicz L. Cytobiochemia PWN 2002
Alberts B i wsp. Podstawy biologii komórki. PWN 2007
Koolman J, Röhm K-H. Biochemia. Ilustrowany przewodnik. Wydawnictwo Lekarskie PZWL, 2005
Bańkowski E. Biochemia - podręcznik dla studentów uczelni medycznych Elsevier Urban & Partner, 2009

Podręczniki do ćwiczeń:
Kłyszejko-Stefanowicz L i wsp. Ćwiczenia z biochemii. PWN, 2005
Zgirski A, Gondko R. Obliczenia biochemiczne. PWN, 1998
Instrukcje do ćwiczeń - dostępne w Katedrze Biochemii

Więcej informacji

Dodatkowe informacje (np. o kalendarzu rejestracji, prowadzących zajęcia, lokalizacji i terminach zajęć) mogą być dostępne w serwisie USOSweb:

Strona przedmiotu 2600-BCHDBIOT-2-S1 w USOSweb