The novel drugs active in central nervous system - searching using in silico computational methods 1700-OG-EN-CNSdrug

Wykłady
Głównym zadaniem wykładów jest zapoznanie studentów z klasyfikacją ATC, oceną właściwości fizykochemicznych, np.: aromatyczność, wiązania rotacyjne, powierzchnia polarna, logP, masa cząsteczkowa, potencjał tworzenia wiązań wodorowych.
Korzystanie z odpowiednich baz danych białek i cząsteczek.
Proces oceny kandydata na lek OUN z wykorzystaniem nowych metod obliczeniowych i modelowania molekularnego.
Ocena potencjalnej toksyczności in silico badanych związków.

Laboratoria:
Student będzie zaangażowany w eksperymenty in silico pozwalające na określenie właściwości farmakologicznych i fizykochemicznych związków. Student zdobędzie praktyczne umiejętności w zakresie oceny potencjalnej aktywności i toksyczności z wykorzystaniem metod modelowania molekularnego, a także zdobędzie umiejętności interpretacji uzyskanych wyników.

Całkowity nakład pracy studenta

Godziny kontaktowe z nauczycielem: - udział w wykładach: 10 godz, - udział w zajęciach laboratoryjnych: 22 godz, - konsultacje z nauczycielem akademickim: 2 godz, - zaliczenie testu: 1 godz. Nakład pracy związany z zajęciami wymagającymi bezpośredniego udziału nauczycieli akademickich wynosi 35 h, co odpowiada 1,4 punktu ECTS. Godziny zajęć realizowanych samodzielnie: - przygotowanie do wykładów: 6 godz. - przygotowanie do laboratoriów: 12 godz. - czytanie literatury: 10 godz. - przygotowanie do egzaminu: 12 godz. Łączny nakład pracy związany z godzinami samodzielnej nauki wynosi 40 godzin, co odpowiada 1,6 punktu ECTS. Łącznie: 75 godz. (3,0 ECTS)

Efekty uczenia się - wiedza

Student: W1: posiada podstawową wiedzę na temat budowy chemicznej głównych substancji aktywnych w ośrodkowym układzie nerwowym. C.W2. (farmacja) W2: posiada specjalistyczną wiedzę związaną z projektowaniem nowych leków o określonych właściwościach i działających na ośrodkowy układ nerwowy. C.W13. (farmacja) W3: ma podstawową wiedzę o budowie, właściwościach fizykochemicznych i farmakologicznych związków organicznych. C.W3. (farmacja)

Efekty uczenia się - umiejętności

Student: U1: potrafi ocenić kandydatów na leki na podstawie ich struktury chemicznej i właściwości fizykochemicznych. C.U3. (farmacja) U2: potrafi wyjaśnić zależność struktura-aktywność związków organicznych. B.U10. (farmacja)

Efekty uczenia się - kompetencje społeczne

Student: K1: rozumie potrzebę ciągłego doskonalenia umiejętności zawodowych. K8 (farmacja)

Metody dydaktyczne

Wykłady: - wykład informacyjny (konwencjonalny) z prezentacją multimedialną - wykład uczestniczący - wykład problemowy Laboratoria: - wykonywanie eksperymentów i analiza problemów.

Rodzaj przedmiotu

przedmiot fakultatywny

Koordynatorzy przedmiotu

Łukasz Fijałkowski
Alicja Nowaczyk

Kryteria oceniania

Metody oceny:
- test (W1-W3, U1-U2)
Wymagana jest odpowiednia liczba punktów z testu końcowego.
Kryteria oceny:
niezaliczenie- 0-59%
zadowalający- 60-67%
zadowalający plus - 68-75%
dobry - 76-83%
dobry plus- 84-90%
bardzo dobry- 91-100%

Literatura

Primary literature:
1. Paroxetine—Overview of the molecular mechanisms of action. Kowalska, M.; Nowaczyk, J.; Fijałkowski, Ł.; Nowaczyk, A., International Journal of Molecular Sciences 2021, 22, (4),
2. Coumar, S. M. Molecular Docking for Computer-Aided Drug Design, Academic Press 2021.
3. Jensen J. H. Molecular Modeling Basics. CRC Press, 2017.
4. Singh D. B. Computer Aided Drug Design. Springer, 2020.
Supplementary literature:
1. Pirhadi, S., Sunseri, J., & Koes, D. R. (2016). Open source molecular modeling. Journal of Molecular Graphics and Modelling, 69, 127-143.
2. Transporter Proteins as Antitarget for Drug Cardiotoxicity. Kowalska, M.; Nowaczyk, J.; Nowaczyk, A., KV11. 1, NaV1. 5, and CaV1. 2 International Journal of Molecular Sciences 2020, 21, (21), 8099.
3. Sabe, V. T., Ntombela, T., Jhamba, L. A., Maguire, G. E., Govender, T., Naicker, T., & Kruger, H. G. (2021). Current trends in computer aided drug design and a highlight of drugs discovered via computational techniques: A review. European Journal of Medicinal Chemistry, 224, 113705.

Więcej informacji

Dodatkowe informacje (np. o kalendarzu rejestracji, prowadzących zajęcia, lokalizacji i terminach zajęć) mogą być dostępne w serwisie USOSweb:

Strona przedmiotu 1700-OG-EN-CNSdrug w USOSweb