Epidemiologia chorób i metody typowania drobnoustrojów 1700-EMNMM-ECh-PS

W czasie zajęć uczestnik poznaje podstawy teoretyczne występowania zakażeń szpitalnych i epidemiologii chorób zakaźnych, a w szczególności rolę metod molekularnych w identyfikacji ognisk epidemicznych i dochodzeniach epidemiologicznych, co stanowi wstęp teoretyczny do analizy przypadków.
W ramach zajęć uczestnik zostaje zapoznany z nowoczesnymi metodami molekularnymi w identyfikacji zakażeń szpitalnych oraz podstawami retrospektywnej analizy takich przypadków.
Uczestnik przeprowadza ponadto analizę epidemiologiczną dzięki zastosowaniu metod molekularnych (np. technika RAPD – randomly amplified polymorphic DNA, analiza restrykcyjna, typowanie, rybotypowanie, HRM – high resolution melting).
Uczestnik nabywa również teoretyczną wiedzę oraz praktyczne umiejętności obsługi dostępnej aparatury do diagnostyki metodami molekularnymi w identyfikacji ognisk epidemicznych oraz podstawowe umiejętności doboru metodologii badawczej i aparatury do molekularnej diagnostyki w badaniach epidemiologicznych.

Całkowity nakład pracy studenta

1. Nakład pracy związany z zajęciami wymagającymi bezpośredniego udziału nauczycieli akademickich wynosi: - udział w wykładach: 3 godziny - udział w seminariach: 3 godziny - udział w laboratoriach: 10 godzin Nakład pracy związany z zajęciami wymagającymi bezpośredniego udziału nauczycieli akademickich wynosi 16 godzin, co odpowiada 0,64 punktu ECTS. 2. Bilans nakładu pracy uczestnika studiów podyplomowycha: - udział w wykładach: 3 godziny - udział w seminariach: 3 godziny - udział w laboratoriach: 10 godzin - czytanie wybranego piśmiennictwa naukowego: 15 godzin - przygotowanie do laboratoriów: 15 godzin - przygotowanie do seminariów: 8 godzin - przygotowanie do wykładów: 2 godziny - przygotowanie do zaliczenia i zaliczenie: 8 godzin - przygotowanie do egzaminu i egzamin: 11 godzin Łączny nakład pracy uczestnika studiów podyplomowycha związany z realizacją przedmiotu wynosi 75 godzin, co odpowiada 3 punktom ECTS.

Efekty uczenia się - wiedza

Uczestnik studiów podyplomowych zna i rozumie: W.1 podstawy teoretyczne występowania zakażeń szpitalnych i epidemiologii chorób zakaźnych, w szczególności rolę metod molekularnych w identyfikacji ognisk epidemicznych i dochodzeniach epidemiologicznych; EUS_W18

Efekty uczenia się - umiejętności

Uczestnik studiów podyplomowych potrafi: U.1 przeprowadzić analizę różnych przypadków klinicznych zdiagnozowanych z wykorzystaniem metod molekularnych stosowanych w medycznym laboratorium diagnostycznym; EUS_U09 U.2 zastosować dostępne metody molekularnych do celów analiz epidemiologicznych (np. technika RAPD – randomly amplified polymorphic DNA, analiza restrykcyjna, typowanie, rybotypowanie, HRM – high resolution melting); EUS_U16 U.3 planować, przeprowadzić analizę oraz interpretować wyniki dochodzenia epidemiologicznego uzyskane w oparciu o dostępną metodologię; EUS_U17

Efekty uczenia się - kompetencje społeczne

Uczestnik studiów podyplomowych gotów jest do: K.1 wyjaśnienia w sposób kompetentny i przystępny zasad dochodzenia epidemiologicznego oraz doradzenia przełożonym w zaplanowaniu optymalnego badanie epidemiologicznego w oparciu o dostępną metodologię; EUS_K11

Metody dydaktyczne

Wykład: - wykład informacyjny (konwencjonalny); - wykład problemowy z prezentacją multimedialną. Seminarium: - wykład problemowy z prezentacją multimedialną. - analiza przypadków. Laboratoria: - klasyczna metoda problemowa, - metoda ćwiczeniowa, - metoda laboratoryjna, - metoda obserwacji, - studium przypadku.

Wymagania wstępne

Uczestnik powinien posiadać podstawową wiedzę z zakresu mikrobiologii klinicznej, epidemiologii oraz metod biologii molekularnej.

Koordynatorzy przedmiotu

Joanna Kwiecińska-Piróg

Kryteria oceniania

Ukierunkowana obserwacja i obserwacja ciągła podczas ćwiczeń (realizacja i prezentacja wykonanych zadań), kolokwium testowe sprawdzające wiedzę uzyskaną w trakcie realizacji przedmiotu, czyli nabycie przez uczestnika wiedzy teoretycznej na temat znaczenia metod molekularnych oraz ich potencjalnego wykorzystania w celach epidemiologicznych identyfikacji ognisk zakażeń z mikrobiologicznym laboratorium diagnostycznym, praktycznych umiejętności obsługi dostępnej aparatury do identyfikacji ognisk epidemicznych metodami molekularnymi oraz podstawowych umiejętności doboru metodologii badawczej i aparatury do molekularnej diagnostyki w badaniach epidemiologicznych.
Egzamin po realizacji wszystkich zajęć z modułu V.

Przedmiot kończy się zaliczeniem na ocenę, która uzyskiwana jest na podstawie testu końcowego zaliczeniowego otwartego i/lub wielokrotnego wyboru.

Uzyskane punkty przelicza się na oceny według następującej skali:
Procent punktów Ocena
≥92% Bardzo dobry
84-91% Dobry plus
76-83% Dobry
68-75% Dostateczny plus
60-67% Dostateczny
<60% Niedostateczny
Ukierunkowana obserwacja uczestnika studiów podyplomowych podczas zajęć: ≥ 60% (U1-U3)
Obserwacja przedłużona: ≥ 50% (K1)
Kolokwium: ≥ 60% (W1, U1-U3, K1)
Egzamin po realizacji wszystkich zajęć z modułu V: ≥ 60% (W1, U1-U3, K1)

Praktyki zawodowe

Nie dotyczy.

Literatura

Literatura podstawowa:
1. Bulanda M., Szostek S. Podstawy mikrobiologii i epidemiologii szpitalnej Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa, 2020
2. Bulanda M., Wójkowska-Mach J. Zakażenia szpitalne w jednostkach opieki zdrowotnej, Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa, 2020
3. Dzierżanowska D. Zakażenia szpitalne, Alfa Medica Press, 2008
4. Jabłoński L., Karwat I.D. Podstawy epidemiologii ogólnej epidemiologia chorób zakaźnych, Wydawnictwo Czelej 2020
5. Brown T.A. Genomy, Wydawnictwo Naukowe PWN, Warszawa, 2009
6. Słomski R: Analiza DNA. Teoria i praktyka, Wydawnictwo Uniwersytet Przyrodniczy, Poznań, 2011
7. Baj J., Markiewicz Z. Biologia molekularna bakterii, Wydawnictwo Naukowe PWN, 2023

Więcej informacji

Dodatkowe informacje (np. o kalendarzu rejestracji, prowadzących zajęcia, lokalizacji i terminach zajęć) mogą być dostępne w serwisie USOSweb:

Strona przedmiotu 1700-EMNMM-ECh-PS w USOSweb