1.1. Biochemia 1600-LekM12BICH-J
Wykład i seminaria:
Funkcje pełnione przez krew, składniki krwi. Organiczne i nieorganiczne składniki osocza. Charakterystyka i funkcje białek osocza. Struktura i funkcje erytrocytów. Główne szlaki metaboliczne krwinki czerwonej. Obrona antyoksydacyjna krwinki czerwonej. Układy redukujące jony Fe3+ do Fe2+ hemoglobiny. Fizjologiczna rola hemoglobiny i mioglobiny odpowiednio w transporcie i magazynowaniu tlenu, krzywa dysocjacji tlenowej. Mechanizm łączenia tlenu z mioglobiną i hemoglobiną (rola histydyny dystalnej i proksymalnej, kooperatywność). Wpływ temperatury, pH, CO2 i 2,3-BPG na krzywą dysocjacji tlenowej Hb. Zmiany w budowie hemoglobiny zachodzące na różnych etapach rozwoju człowieka (hemoglobina zarodkowa, płodowa, człowieka dorosłego). Hemoglobina glikozylowana HbA1c - budowa, rola, znaczenie diagnostyczne. Hemoglobinopatie (HbS, HbM). Przyczyny i typy niedokrwistości (anemie).Synteza i katabolizm hemu, regulacja tych procesów. Transport bilirubiny w osoczu, łączenie z kwasem glukuronowym w wątrobie, wydalanie z żółcią i redukcja do urobilinogenu. Krążenie wątrobowo-jelitowe barwników żółciowych. Hyperbilirubinemie, różne typy żółtaczek, ich przyczyny i mechanizm (anemia hemolityczna, zapalenie wątroby, żółtaczka mechaniczna). Testy laboratoryjne przydatne w diagnozowaniu i różnicowaniu żółtaczek przedwątrobowych, wątrobowych i pozawątrobowych.
Nasycone i nienasycone kwasy tłuszczowe, ich nomenklatura i struktura. Acyloglicerole, fosfoacyloglicerole, sfingolipidy, steroidy, eikozanoidy. Struktura i funkcje cholesterolu. Pochodne cholesterolu (witamina D, hormony steroidowe, kwasy żółciowe) i ich rola w organizmie. Witaminy. Synteza cholesterolu i regulacja tego procesu w organizmie człowieka. Transport cholesterolu we krwi przez lipoproteiny. Medyczne znaczenie podwyższonego i obniżonego stężenia cholesterolu we krwi. Dyslipoproteinemie. Aktywacja długołańcuchowych kwasów tłuszczowych i ich transport do mitochondrium. β-oksydacja kwasów tłuszczowych nasyconych i nienasyconych. Bilans energetyczny β-oksydacji. β-oksydacja kwasów tłuszczowych o nieparzystej liczbie atomów węgla w łańcuchu. Przekształcenie propionylo- CoA do bursztynylo-CoA. Metabolizm ciał ketonowych. Transport acetylo-CoA z mitochondrium do cytozolu (rola cytrynianu). Źródła NADPH do syntezy kwasów tłuszczowych. Synteza kwasów tłuszczowych. Elongacja kwasów tłuszczowych. Tworzenie wiązań nienasyconych – desaturaza. Przekształcenie kwasu linolowego do kwasu arachidonowego. Synteza eikozanoidów i ich fizjologiczne znaczenie. Synteza triacylogliceroli. Synteza glicerolofosfolipidów i sfingolipidów. Powiązania szlaków metabolicznych lipidów i węglowodanów. Nomenklatura i struktura zasad purynowych i pirymidynowych głównych oraz nietypowych. Budowa nukleotydów. Synteza puryn i pirymidyn oraz regulacja tych procesów. Szlak rezerwowy syntezy puryn i pirymidyn. Synteza dezoksyrybonukleotydów. Katabolizm zasad purynowych i pirymidynowych. Zespół Lescha-Nyhana, dna moczanowa, ciężki złożony niedobór immunologiczny (SCID).Struktura kwasów nukleinowych (DNA B, Z, A; mRNA, tRNA, rRNA). Biologia molekularna procesów nowotworzenia. Metabolizm azotu aminowego: Najważniejsze enzymy zaangażowane w przemiany aminokwasów i usuwanie azotu aminowego (transaminazy, dehydrogenaza glutaminianowa, dehydratazy, glutaminaza, asparaginaza, oksydazy aminokwasowe, syntetaza asparaginowa i glutaminowa). Wbudowywanie azotu aminokwasowego w cząsteczkę mocznika - cykl mocznikowy, jego przebieg i kompartmentacja w komórce. Katabolizm aminokwasów: Losy szkieletów węglowych aminokwasów. Aminokwasy glukogenne i ketogenne. Rola fosforanu pirydoksalu, tetrahydrofolianu i tetrahydrobiopteryny w metabolizmie aminokwasów. Wybrane metaboliczne zaburzenia w katabolizmie aminokwasów: alkaptonuria, fenyloketonuria, choroba "moczu o zapachu syropu klonowego". Przemiany aminokwasów w biologicznie ważne, wyspecjalizowane produkty takie jak: betaina, hormony tarczycy, sfingozyna, cholina, tauryna, kreatyna, aminy katecholowe, kwas hipurowy, tlenek azotu (NO), glutation, glicerolofosfolipidy, puryny, pirymidyny, karnozyna, anseryna, kwasy żółciowe, hem, serotonina, melatonina, melaniny, kwas nikotynowy, koenzym A, PAPS. Synteza amin biogennych w wyniku procesu dekarboksylacji aminokwasów, nazewnictwo i biologiczna rola amin biogennych. Metabolizm reszt jednowęglowych: rola tetrahydrofolianu (FH4), witaminy B12, S-adenozylometioniny (SAM). Związki będące donorem i akceptorem puli reszt jednowęglowych FH4. Mechanizm pułapki folianowej. Rola SAM w biosyntezie związków biologicznie ważnych takich jak: kreatyna, acetylocholina, fosfatydylocholina, adrenalina, melatonina, metylowane nukleotydy w cząsteczce DNA i RNA, metylowane DNA. Rodzaje soków trawiennych, ich pH oraz skład (w tym szczególnie skład enzymatyczny). Trawienie i wchłanianie węglowodanów, lipidów, białek, kwasów nukleinowych, witamin i soli mineralnych. Mechanizm syntezy kwasu solnego przez komórki okładzinowe żołądka. Zróżnicowana rola kwasu solnego. Biosynteza kwasów żółciowych i regulacja tego procesu. Rola kwasów żółciowych w procesie trawienia. Krążenie wątrobowo-jelitowe kwasów żółciowych oraz sposób ich usuwania z organizmu.Wolne rodniki tlenowe i reaktywne formy tlenu. Rodzaje mechanizmów obronnych. Wykrywanie aktywności enzymów spełniających rolę katalizatorów oksydo-redukcyjnych w organizmie człowieka. Systemy ochrony przed skutkami działania RFT. Antyoksydanty enzymatyczne (ceruloplazmina, oksydaza cytochromowa, katalaza, dysmutaza ponadtlenkowa, peroksydaza glutationowa, reduktaza glutationowa). Antyoksydacyjne właściwości glutationu. Udział glutationu w detoksykacji RFT oraz nadtlenku wodoru i nadtlenków organicznych. Rola stresu oksydacyjnego w inicjacji i rozwoju chorób: miażdżyca, cukrzyca, nowotwory.Powiązania pomiędzy różnymi szlakami metabolicznymi węglowodanów, tłuszczów, aminokwasów (związki kluczowe w metabolizmie, rola nukleotydów w aktywacji substratów do biosyntez). Główne choroby metaboliczne nerek, serca i wątroby.
Ćwiczenia: hemoglobina i jej pochodne we krwi człowieka, właściwości fizjologiczne ważnych lipidów, lipidogram, preparatyka kwasów nukleinowych, analiza jakościowa preparatów kwasów nukleinowych, diagnostyczne znaczenie oznaczania metabolitów wydalanych z moczem, diagnostyczne znaczenie oznaczania stężenia związków pojawiających się w moczu w stanach patologicznych
Enzymy diagnostyczne krwi, enzymatyczne składniki układu pokarmowego, stres oksydacyjny i układy antyoksydacyjne w organizmie człowieka, metabolizm wybranych narządów.
Całkowity nakład pracy studenta
Efekty uczenia się - wiedza
Efekty uczenia się - umiejętności
Efekty uczenia się - kompetencje społeczne
Metody dydaktyczne
Metody dydaktyczne eksponujące
Metody dydaktyczne podające
- wykład konwersatoryjny
- wykład problemowy
Metody dydaktyczne poszukujące
- laboratoryjna
- referatu
- seminaryjna
- ćwiczeniowa
- klasyczna metoda problemowa
Rodzaj przedmiotu
Wymagania wstępne
Kryteria oceniania
Egzamin - W1-W10
% punktów ocena
92-100 Bardzo dobry
84-91 Dobry plus
76-83 Dobry
68-75 Dostateczny plus
56-67 Dostateczny
0-55 Niedostateczny
Kolokwium – W1-W10, U1
% punktów ocena
92-100 Bardzo dobry
84-91 Dobry plus
76-83 Dobry
68-75 Dostateczny plus
56-67 Dostateczny
0-55 Niedostateczny
Sprawozdania –W1-W10, U2-U3
Praktyczne wykonanie ćwiczeń – U1-U3
Aktywność – K1, K2
Przedłużona obserwacja – K1, K2
Praktyki zawodowe
nie dotyczy
Literatura
Podstawowa:
Murray RK, Granner DK, Mayes PA, Rodwell VV Biochemia Harpera, PZWL 2010, 2012.
Uzupełniająca:
Kłyszejko-Stefanowicz L. Ćwiczenia z biochemii, PWN 2011.
Jeremy M. Berg, Lubert Stryer, John L. Tymoczko Biochemia, PWN 2003 i 2011.
Bańkowski E. Biochemia, Urban&Partner 2009, wyd. 2.
Gumińska M. Zarys biochemii ogólnej dla studentów farmacji i analityki medycznej, Wydawnictwo Uniwersytetu Jagiellońskiego, 1998.
Kłyszejko-Stefanowicz L. Cytobiochemia, PWN 2002
Więcej informacji
Dodatkowe informacje (np. o kalendarzu rejestracji, prowadzących zajęcia, lokalizacji i terminach zajęć) mogą być dostępne w serwisie USOSweb: