Badanie właściwości fizykochemicznych molekuł 0600-S2-PP-ChSO-BWFM
Wykład (zagadnienia zostaną odpowiednio wybrane w zależności od wcześniejszych kursów ukończonych przez studenta)
- postulaty mechaniki kwantowej, energia całkowita, hamiltonian, przybliżenie Borna-Oppenheimera, powierzchnia energii potencjalnej, znaczenie minimów i punktów siodłowych, idea obliczeń 'single point' oraz optymalizacji geometrii, podstawy metod optymalizacyjnych (metody najbardziej stromego zejścia, metody sprzężonego gradientu, metody Newtona-Raphsona, metody pseudo-Newtona-Raphsona), hessian i analiza częstości, przykłady optymalizacji geometrii
- bazy funkcyjne: przybliżenie LCAO MO, baza zupełna, orbitale typu Slatera, orbitale typu Gaussa, klasyfikacja baz funkcyjnych, funkcje polaryzacyjne, balans bazy funkcyjnej, funkcje dyfuzyjne, wykładniki funkcji, skontraktowane bazy funkcyjne i funkcje skontraktowane, bazy Pople'a, bazy funkcyjne Dunninga-Huzinagi, bazy funkcyjne Ahlrichsa, bazy funkcyjne Dunninga typu 'correlation consistent', bazy funkcyjne Jensena typu 'polarization consistent'
- metoda Hartree-Focka i metoda SCF
- teoria funkcjonału gęstości (DFT)
- koncepcyjna metoda DFT (cDFT) i wybrane indeksy reaktywności (potencjał jonizacji, powinowactwo elektronowe, elektronowy potencjał chemiczny, elektroujemność, twardość, miękkość, elektrofilowość, itp.)
- właściwości termochemiczne (np. entalpia reakcji)
- właściwości elektryczne
- wybrane typy międzycząsteczkowych oddziaływań niekowalencyjnych (np. wiązanie wodorowe, wiązanie halogenowe, wiązanie pi-stakingowe, wiązanie agostyczne)
Laboratorium:
1. Obliczenia energii całkowitej dla zadanej geometrii ('single point)
2. Częściowa i pełna optymalizacja geometrii cząsteczki.
3. Analiza wibracyjna (częstości) i wyznaczanie widma IR
4) Analiza konformacyjna (otrzymywanie struktur stabilnych, analiza charakteru otrzymanych punktów stacjonarnych, otrzymywanie energii względnych)
a) badania konformacyjne 3-aminoakroleiny
b) badanie tautomerii enamino-iminoenolowej
5) Wyznaczanie potencjału jonizacji oraz powinowactwa elektronowego
6) Wyznaczanie HOMO-LUMO gap
7) Wyznaczanie wybranych indeksów reaktywności (np. elektronowy potencjał chemiczny, elektroujemność, twardość, miękkość, itp.)
8) Obliczenia termochemiczne (np. wyznaczanie entalpii reakcji)
9) Badanie mechanizmów reakcji (wyznaczanie energii stanu przejściowego, szukanie ścieżki reakcji i wyznaczanie jego profilu energetycznego (IRC))
10) Obliczanie wybranych właściwości elektrycznych
11) Badanie efektów (geometrycznych i spektroskopowych) związanych z obecnością wiązania wodorowego
Całkowity nakład pracy studenta
Efekty uczenia się - wiedza
Efekty uczenia się - umiejętności
Efekty uczenia się - kompetencje społeczne
Koordynatorzy przedmiotu
Metody dydaktyczne
Metody dydaktyczne poszukujące
Wymagania wstępne
Kryteria oceniania
wykład -- egzamin pisemny
laboratorium -- zaliczenie na ocenę (na podstawie oceny pracy na pracowni, aktywności, projektów własnych i możliwych krótkich sprawdzianów)
Praktyki zawodowe
nie dotyczy
Literatura
Literatura podstawowa:
1. Strona internetowa programu Gamess:
https://www.msg.chem.iastate.edu/gamess/index.html
2. Strona internetowa programu Molden:
https://www.theochem.ru.nl/molden/
Literatura uzupełniająca:
1) F. Jensen, Introduction to Computational Chemistry, Wiley, Germany, 2008.
2) J. H. Jensen, Molecular Modeling Basics, CRC Press, 2010
3) A. Hinchliffe, Molecular Modelling for Beginners, Wiley, 2008
Więcej informacji
Dodatkowe informacje (np. o kalendarzu rejestracji, prowadzących zajęcia, lokalizacji i terminach zajęć) mogą być dostępne w serwisie USOSweb: