Strukturalne podstawy aktywności substancji czynnych 0600-S2-CM-SPASC

Studenci poznają podstawy model klucz-zamek i indukowanego dopasowania dla projektowania leków. Omawiane zostaną metody projektowania w oparciu o strukturę celu, związku wiodącego, naturalnych substratów i produktów, oraz stanu przejściowego. Studenci poznają teorię czynników struktury i metody rozwiązania problemu fazowego (metoda Pattersona, metody bezpośrednie). Na zajęciach laboratoryjnych, w oparciu o dane dyfrakcyjne studenci będą rozwiązywać problem fazy metodą Pattersona lub metodami bezpośrednimi. Studenci zostaną również zapoznani z pakietem programów SHELX oraz WinGX do rozwiązania struktury i jej udokładnienia. Na podstawie uzyskanych danych strukturalnych będą przygotowane zbiory Crystal Information File (CIF). Studenci będą weryfikować jakość określonej struktury z użyciem oprogramowania zalecanego przez International Union of Crystallography, oraz Cambridge Crystallographic Data Centre. Studenci wykorzystają wybrane struktury kompleksów białek w bazie PDB do określenia elementów architektury liganda istotnych dla oddziaływań z biomakrocząsteczkami. Na podstawie literatury powiążą aktywność biologiczną z budową ligandów. W oparciu o to studenci podejmą próbę zaprojektowania nowych ligandów.