Projektowanie leków 0600-S2-CM-PW-PL

Celem przedmiotu jest zapoznanie studenta z etapami procesu projektowania leków. Omówione zostanie podejście klasyczne w oparciu o analizę bibliotek związków, m.in. bibliotekę leków dopuszczoną do obrotu przez FDA (FDA-approved Drug Library) oraz testy in vitro. Przedstawione zostaną także nowoczesne metody badania oddziaływania białko-ligand (spektroskopia fluorescencyjna, powierzchniowy rezonans plazmowy, termoforeza w mikroskali). Studenci zostaną również zapoznani
z projektowaniem substancji aktywnych wspomaganym komputerowo, które oparte jest na znajomości struktury receptora lub jego modelu 3D oraz struktur ligandów wiązanych w centrum aktywnym danego enzymu. Zostaną omówione metody pozyskiwania białek rekombinowanych, proces krystalizacji białek i kompleksów białko-ligand. Przedstawione zostaną również techniki umożliwiające otrzymanie struktur 3D związków małocząsteczkowych oraz biomakromolekuł. Omówiona zostanie także metoda umożliwiająca analizę zależności między aktywnością biologiczną grupy ligandów, a ich cechami fizykochemicznymi (QSAR- Quantitative Structure - Activity Relationships). Studenci zdobędą umiejętności dotyczące budowy farmakoforu, modelowania homologicznego oraz dokowania ligandów do receptora (AutoDock Vina).