Projektowanie i chemia analityczna związków aktywnych 0600-S1-ChK-W-PCAZA
Celem przedmiotu jest zapoznanie studenta z podstawową wiedzą dotyczącą symetrii cząsteczek. Studenci poznają również etapy procesu projektowania substancji aktywnych. Omówione zostanie podejście klasyczne w oparciu o analizę bibliotek związków, m.in. bibliotekę leków dopuszczoną do obrotu przez FDA (FDA-approved Drug Library) oraz testy in vitro. Studenci zostaną również zapoznani z projektowaniem substancji aktywnych wspomaganym komputerowo, które oparte jest na znajomości struktury receptora lub jego modelu 3D oraz struktur ligandów wiązanych w centrum aktywnym danego enzymu. Przedstawione zostaną także nowoczesne metody badania oddziaływania białko-ligand (spektroskopia fluorescencyjna, powierzchniowy rezonans plazmowy, termoforeza w mikroskali). Zostaną omówione metody pozyskiwania białek rekombinowanych, proces krystalizacji białek i kompleksów białko-ligand. Przedstawione zostaną również techniki umożliwiające otrzymanie struktur 3D związków małocząsteczkowych oraz biomakromolekuł. Studenci zdobędą również umiejętności pozyskiwania danych z baz strukturalnych. Zostaną także omówione zasady oznaczania składu jakościowego oraz przedstawiona zostanie szczegółowa charakterystyka metod umożliwiających oznaczenie stężenie analitów farmakologicznych i biochemicznych w próbkach różnego pochodzenia. Uzyskiwana stopniowo wiedza z zakresu metod analitycznych w powiązaniu z wiedzą na temat właściwości fizykochemicznych poszczególnych klas związków pozwali na samodzielny dobór odpowiedniej procedury postępowania analitycznego, która ma doprowadzić do uzyskania wiarygodnego i miarodajnego wyniku oznaczenia. Z drugiej strony samodzielne rozwiązywanie problemów napotkanych w trakcie realizacji zadań, pozwali na oszacowanie i walidację wielkości popełnianego błędu oznaczenia.
Całkowity nakład pracy studenta
Efekty uczenia się - wiedza
Efekty uczenia się - umiejętności
Efekty uczenia się - kompetencje społeczne
Metody dydaktyczne
Metody dydaktyczne podające
- opis
- pogadanka
Metody dydaktyczne poszukujące
- ćwiczeniowa
- projektu
Rodzaj przedmiotu
Wymagania wstępne
Koordynatorzy przedmiotu
Kryteria oceniania
Zaliczenie laboratorium na podstawie obecności oraz raportu z wykonanego w trakcie zajęć zadania. Zaliczenie wykładu w formie egzaminu pisemnego.
Praktyki zawodowe
Nie dotyczy
Literatura
1. Z. Bojarski, M. Gigla, K. Stróż, M. Surowiec, Krystalografia, PWN, 2014.
2. R. B. Silverman, Chemia organiczna w projektowaniu leków, WNT 2004.
3. International Tables For X-ray Crystallography.
4. J. Drenth, Principles of Protein X-Ray Crystallography, Springer-Verlag, 2010.
5. I. Baranowska, B. Buszewski [red.], Bioanalityka w nauce i życiu - tom 1, PWN, Warszawa 2020, wyd. 1. ISBN: 978-83-01-21281-0.
6. B. Buszewski, M. Szultka-Młyńska, Modern Separation Techniques, UMK, Toruń 2020, wyd. 1. ISBN: 978-83-231-4516-5.
Więcej informacji
Dodatkowe informacje (np. o kalendarzu rejestracji, prowadzących zajęcia, lokalizacji i terminach zajęć) mogą być dostępne w serwisie USOSweb: