Conducted in
term:
2022/23L
ISCED code: 0511
ECTS credits:
5
Language:
Polish
Organized by:
Faculty of Biological and Veterinary Sciences
Genomics and transcriptomics 2600-BK-GTBIOL-2-S2
This course has not yet been described...
Total student workload
Lectures - 30 h
Unassisted work - 100 h
Learning outcomes - knowledge
(in Polish) W1 – zna współczesne metody sekwencjonowania DNA – K_W01, K_W03, K_W09
W2 – zna metody przygotowania materiału do analiz genomicznych i transkryptomicznych -
W3 – zna oprogramowanie odpowiednie do analizy danych sekwencyjnych – K_W08, K_W12
W4 – wie jak interpretować wyniki analiz genomicznych i transkryptomicznych w duchu biologii systemów – K_W10, K_W15
Learning outcomes - skills
(in Polish) U1 – umie zaplanować doświadczenia genomiczne i transkryptomiczne – K_U02, K_U07
U2 – umie dobrać metody doświadczalne do celów analiz – K_U02, K_U03
U3 – umie świadomie dobrać oprogramowanie do analizy danych sekwencjnych – K_U01, K_U04
U4 – umie krytycznie zinterpretować wyniki analiz bioinformatycznych i zrefereować je – K_U08, K_U15
Learning outcomes - social competencies
(in Polish) K1 – śledzi rozwój metodologii w zakresie genomiki i transkryptomiki – K_K01, K_K02
K2 – jest świadomy ograniczeń stosowanych metod – K_K06
K3 – jest świadomy konieczności zastosowania właściwych narzędzi i metod statystycznych - K_K08
Teaching methods
Lecture with multimedia presentation
Expository teaching methods
- informative (conventional) lecture
Type of course
compulsory course
Prerequisites
Statistics at a level enabling understanding the differentially expressed gene conception, particularly the need to correct for multiple comparisons (False Discovery Rate). Knowledge of biochemistry and molecular biology enabling understanding how sequencing methods work and libraries are constructed.
Course coordinators
Practical placement
Not applicable
Bibliography
Genomes 5, TA Brown, 2023, CRC Press, New York, NY
Additional information
Additional information (registration calendar, class conductors, localization and schedules of classes), might be available in the USOSweb system: