Elements of computational chemistry and biocomputing 0600-S2-ChK-EChOBI

This course has not yet been described...

Total student workload

90 hours

Learning outcomes - knowledge

W1: zna możliwości jakie przynosi wykorzystanie programów chemii obliczeniowej i baz danych w celu wspomagania i interpretowania eksperymentu - K_W16

Learning outcomes - skills

U1: posługuje się programami chemii obliczeniowej oraz bazami danych w celu wspomagania i interpretowania eksperymentu - K_U11

Learning outcomes - social competencies

K1: zna ograniczenia własnej wiedzy i rozumie potrzebę dalszego uczenia się przez całe życie; potrafi samodzielnie podjąć działania w celu poszerzania i pogłębiania wiedzy chemicznej - K_K01 K2: potrafi formułować i przedstawiać opinie na temat podstawowych zagadnień chemicznych w chemii kosmetycznej lub chemii gospodarczej i osiągnięć w tych dyscyplinach - K_K06

Course coordinators

Anna Kaczmarek-Kędziera
Dariusz Kędziera

Teaching methods

Lecture, discussion, presentation, project, case study

Observation/demonstration teaching methods

- display

Expository teaching methods

- problem-based lecture
- narration
- discussion
- informative (conventional) lecture
- participatory lecture

Exploratory teaching methods

- case study
- practical
- seminar
- brainstorming
- experimental
- classic problem-solving
- project work

Type of course

compulsory course

Prerequisites

Organic chemistry

Assessment criteria

Lecture: Written or oral exam – W1, U1 or alternatively
Reflection journal
Reports on completed research projects
Presentation
Quizzes
Student self-assessment according to assessment criteria
Laboratory: Completion of a computational project on a topic of the student’s choice – W1, U1, K1, K2
Student self-assessment according to assessment criteria

Bibliography

Literatura podstawowa:
1. Chemia obliczeniowa w laboratorium organicznym, Anna Kaczmarek-Kędziera, Marta Ziegler-Borowska, Dariusz Kędziera, Wydawnictwo Naukowe UMK, Toruń, 2014.
2. Chemia organiczna (część 1), Jonathan Clayden, Nick Greeves, WNT 2014.
3. Białka i peptydy, Shawn Doonan, Wydawnictwo Naukowe PWN 2008.
4. Bioinformatyka. Podręcznik do analizy genów i białek, Andreas D. Baxevanis, B.F. Francis Ouellette, Wydawnictwo Naukowe PWN 2004.
5. Bioinformatyka i ewolucja molekularna, Teresa K. Attword, Paul G. Higgs, Wydawnictw Naukowe PWN 2011.
Literatura uzupełniająca:
1. Elementarne metody chemii kwanrowej, Andrzej J. Sadlej, Wydawnictwo Naukowe PWN 1969.
2. Elementy chemii kwantowej sposobem niematematycznym wyłożone, Włodzimierz Kołos, PWN, 1986.
3. Molecular orbitals and organic chemical reactions, Ian Fleming, Wiley 2010.

Term 2024/25Z:

(do 65 tys. znaków)
Literatura podstawowa:
1. Chemia obliczeniowa w laboratorium organicznym, Anna Kaczmarek-Kędziera, Marta Ziegler-Borowska, Dariusz Kędziera, Wydawnictwo Naukowe UMK, Toruń, 2014.
2. Chemia organiczna (część 1), Jonathan Clayden, Nick Greeves, WNT 2014.
3. Białka i peptydy, Shawn Doonan, Wydawnictwo Naukowe PWN 2008.
4. Bioinformatyka. Podręcznik do analizy genów i białek, Andreas D. Baxevanis, B.F. Francis Ouellette, Wydawnictwo Naukowe PWN 2004.
5. Bioinformatyka i ewolucja molekularna, Teresa K. Attword, Paul G. Higgs, Wydawnictw Naukowe PWN 2011.
Literatura uzupełniająca:
1. Elementarne metody chemii kwanrowej, Andrzej J. Sadlej, Wydawnictwo Naukowe PWN 1969.
2. Elementy chemii kwantowej sposobem niematematycznym wyłożone, Włodzimierz Kołos, PWN, 1986.
3. Molecular orbitals and organic chemical reactions, Ian Fleming, Wiley 2010.

Term 2025/26Z:

Additional information

Additional information (registration calendar, class conductors, localization and schedules of classes), might be available in the USOSweb system:

Description of 0600-S2-ChK-EChOBI in USOSweb